Quy trình vận hành của hệ thống gồm các bước như sau.

1. Người tiêu dùng:

   • Đăng ký về nhu cầu tiêu dùng với hệ thống thông qua việc join các nhóm tiêu chuẩn

   • Thông báo với hệ thống về các vấn đề phát sinh về chất lượng và nhu cầu trong quá trình vận hành

   • Nhận hàng và kiểm tra các tiêu chí về chất lượng cũng như số lượng của sản phẩm

   • Tiến hành thanh toán cho hệ thống

2. Hệ thống

   • Quản lý các đối tượng tham gia và chuỗi cung ứng

   • Minh bạch về thông tin với các thành phần

   • Điều phối về nhu cầu tiêu dùng

   • Cung cấp tiện ích về CNTT hỗ trợ người tiêu dùng quản lý được các thông tin cần thiết

3. Nhà cung cấp

   • Tiến hành nhận yêu cầu về tiêu dùng của hệ thống

   • Tiến hành cung cấp thực phẩm theo nhu cầu

   • Sơ chế thực phẩm bảo bảo thực phẩm được sơ chế sạch sẽ và đáp ứng an toàn thực phẩm

   • Dán temp xuất xứ với các sản phẩm

   • Tiến hành vận chuyển tới đơn vị quản lý chất lượng

4. Đơn vị quản lý chất lượng

   • Tiến hành nhận thực phẩm đã được sơ chế từ nhà cung cấp

   • Kiểm tra chất lượng thực phẩm theo các tiêu chí của từng loại thực phẩm

   • Tiến hành chia các thành phần theo như thông tin của hệ thống cung cấp

   • Vận chuyển giao cho người tiêu dùng

Mỗi đối tượng tham gia trong hệ thống đều là một thành phần quan trọng để đảm bảo về chất lượng và tính minh bạch cao trong chuỗi cung ứng foodcoop.vn, hệ thống có trách nghiệm điều phối về thông tin và tham gia giám sát về tất cả các bước đảm bảo tất cả các bước hoạt động được nhất quán, toàn vẹn, tiện lợi cho người tiêu dùng.